Приехал в Париж в 1937 году. Учился в мастерской Энгра и вскоре занял достойное место среди художников своего времени.
Выставлялся на Парижском Салоне с 1837 по 1865 годы. Среди его работ выделяются картины: "Папа Александр III, скрывающийся от убийц в облике нищего", выставленного в Люксембургском музее; "Нерон перед телом Агриппины" в музее Энгра в Монтобане; "Сестры милосердия спасают раненых в Крыму" в Версальском музее. Известны также два его натюрмортра в музее Изобразительных искусств в Дижоне.
В 1838 году Аппер подарил своему родному городу Анже свою работу "Вакханки".
Аппер выполнил ряд государственных заказов: фрески церкви Сен-Мари; часовня госпиталя Анже; роспись украшений во дворцах Тюильри и Лувр.
В 1859 награжден званием Рыцаря Почетного легиона Франции.
В 1851 году Эжен Аппер женится на Мари Леони Леруа, дочери анжуйского садовода Андре Леруа, владельца крупнейшего во Франции садоводства и городского советника Анже.
Биография из E.BENEZIT:"DICTIONNAIRE DES PEINTRES, SCULPTEURS, DESSINATEURS, ET GRAVEURS", том 1, стр. 235.